Jest autorką i współautorką ponad 135 publikacji naukowych w uznanych międzynarodowych czasopismach o wysokim współczynniku wpływu (Impact Factor), a także 15 rozdziałów w monografiach wydanych przez wydawnictwa naukowe.
Prace prof. Masek cytowano już ponad 2 900 razy od 2009 roku (Scopus), a indeks H wynosi 28. Dwukrotnie znalazła się na prestiżowej liście „World’s Top 2% Scientists”, obejmującej najczęściej cytowanych naukowców na świecie.
Dorobek badaczki obejmuje również 41 patentów i zgłoszeń patentowych, spośród których część została skomercjalizowana i wdrożona do przemysłu, przynosząc wymierne korzyści dla gospodarki w zakresie ochrony środowiska i rozwoju zielonych technologii. Opracowane przez nią technologie dotyczą m.in. nowej generacji biodegradowalnych materiałów polimerowych, rozwiązań o zwiększonej odporności eksploatacyjnej oraz ekologicznych alternatyw ograniczających zużycie surowców naturalnych, ekologicznych opakowań.
Jako lider i kierownik projektów badawczych prof. Anna Masek realizowała liczne przedsięwzięcia naukowe o zasięgu krajowym i międzynarodowym, finansowane w ramach prestiżowych programów badawczych, np. takich jak: LIDER, POIR, Juventus Plus oraz Horyzont Europa.
Istotną część jej dorobku stanowią również wieloletnie projekty badawczo-rozwojowe finansowane przez sektor przemysłowy, ukierunkowane na wdrażanie innowacyjnych rozwiązań w zakresie nowoczesnych biomateriałów. Projekty te obejmowały zarówno badania fundamentalne, jak i prace aplikacyjne oraz wdrożeniowe, co pozwoliło na skuteczne łączenie wartości poznawczej z praktycznym zastosowaniem uzyskanych wyników. Szczególne znaczenie miała także współpraca z uznanymi ośrodkami naukowymi i przemysłowymi w Europie oraz USA, która nadaje działalności prof. Masek wymiar międzynarodowy i podkreśla jej wpływ na rozwój nauki i technologii polimerów.
Za działalność naukową i wynalazczą otrzymała wiele prestiżowych nagród i wyróżnień, m.in. medale i nagrody specjalne na międzynarodowych wystawach wynalazków, prestiżowe wyróżnienie Polskiej Agencji Rozwoju Przedsiębiorczości w konkursie „Polski Produkt Przyszłości”, a także nagrodę Eureka 2020 za innowacyjne rozwiązania w zakresie biomateriałów polimerowych.
Od wielu lat kieruje unikalnym w skali kraju laboratorium symulowanych badań starzeniowych dla materiałów polimerowych w Instytucie Technologii Polimerów i Barwników, Wydziału Chemicznego Politechnice Łódzkiej oraz pełni funkcję prezesa łódzkiego oddziału Stowarzyszenia Inżynierów i Techników Przemysłu Chemicznego.
Jest promotorem i opiekunem naukowym licznych rozpraw doktorskich, w tym doktoratów wdrożeniowych, a także ponad 140 prac dyplomowych inżynierskich i magisterskich. Opiekuje się także studenckim kołem naukowym "Polimer".